Resultados y clasificación

Tras caer eliminado en la Copa del Rey ante el Portuense el Granada C.F. pasó a la Copa Federación (RFEF) enfrentándose al Marbella tras determinarlo así el sorteo celebrado en Las Rozas (Madrid) el lunes 27 de noviembre de 2006. Los posibles rivales eran Marbella, Fuerteventura y Tenerife B después de establecerse así por proximidad geográfica, siendo el azar el que decidió que fuera el otro conjunto andaluz el rival. Tras una fase autonómica de la competición y una eliminatoria previa hay 32 equipos que optan al trofeo y por tanto la primera ronda a disputar son los dieciseisavos de final, que se juegan a doble partido.

Dieciseisavos de final

6 de diciembre de 2006  17:30
Partido de ida
13 de diciembre de 2006  21:00
Partido de vuelta
El Granada C.F. clasificado para los octavos de final.

El sorteo de los octavos de final celebrado en la sede de la RFEF el jueves 21 de diciembre de 2006 permitió que se determinara entre los posibles rivales, Alicante, Mazarrón o el vencedor de la eliminatoria entre el Villajoyosa y el Ontinyent, que sea el ganador de este último choque el rival contra el que se jugará el jueves 11 de enero de 2007, la ida, y el jueves 25 de enero de 2007, la vuelta. En el sorteo estuvo presente Ramón Moraleda por parte del Granada C.F. como único representante de los 18 clubes implicados en el mismo. El ganador de la eliminatoria fue finalmente el Ontinyent.